行政機關為行政行為時，除法律另有規定外，應依本法規定為之。
下列機關之行政行為，不適用本法之程序規定：
一、各級民意機關。
二、司法機關。
三、監察機關。
下列事項，不適用本法之程序規定：
一、有關外交行為、軍事行為或國家安全保障事項之行為。
二、外國人出、入境、難民認定及國籍變更之行為。
三、刑事案件犯罪偵查程序。
四、犯罪矯正機關或其他收容處所為達成收容目的所為之行為。
五、有關私權爭執之行政裁決程序。
六、學校或其他教育機構為達成教育目的之內部程序。
七、對公務員所為之人事行政行為。
八、考試院有關考選命題及評分之行為。

當事人於行政程序中，除得自行提出證據外，亦得向行政機關申請調查事
實及證據。但行政機關認為無調查之必要者，得不為調查，並於第四十三
條之理由中敘明之。

行政機關為瞭解事實真相，得實施勘驗。
勘驗時應通知當事人到場。但不能通知者，不在此限。

事業應採行水污染防治措施；其水污染防治措施之適用對象、範圍、條件
、必備設施、規格、設置、操作、監測、記錄、監測紀錄資料保存年限、
預防管理、緊急應變，與廢 (污) 水之收集、處理、排放及其他應遵行事
項之管理辦法，由中央主管機關會商相關目的事業主管機關定之。

各級主管機關得派員攜帶證明文件，進入事業、污水下水道系統或建築物
污水處理設施之場所，為下列各項查證工作：
一、檢查污染物來源及廢 (污) 水處理、排放情形。
二、索取有關資料。
三、採樣、流量測定及有關廢 (污) 水處理、排放情形之攝影。
各級主管機關依前項規定為查證工作時，其涉及軍事秘密者，應會同軍事
機關為之。
對於前二項查證，不得規避、妨礙或拒絕。
檢查機關與人員，對於受檢之工商、軍事秘密，應予保密。

事業或污水下水道系統排放廢（污）水，違反第七條第一項或第八條規定
者，處新臺幣六萬元以上二千萬元以下罰鍰，並通知限期改善，屆期仍未
完成改善者，按次處罰；情節重大者，得令其停工或停業；必要時，並得
廢止其水污染防治許可證（文件）或勒令歇業。
畜牧業違反第七條第一項或第八條之規定者，處新臺幣六千元以上六十萬
元以下罰鍰，並通知限期改善，屆期仍未完成改善者，按次處罰；情節重
大者，得令其停工或停業；必要時，並得廢止其水污染防治許可證（文件
）或勒令歇業。

規避、妨礙或拒絕第二十六條第一項之查證者，處新臺幣三萬元以上三百
萬元以下罰鍰，並得按次處罰及強制執行查證工作。

本法之停工或停業、撤銷、廢止許可證之執行，由主管機關為之；勒令歇
業，由主管機關轉請目的事業主管機關為之。

事業、污水下水道系統或建築物污水處理設施，排放廢 (污) 水於地面水
體者，應符合放流水標準。
前項放流水標準，由中央主管機關會商相關目的事業主管機關定之，其內
容應包括適用範圍、管制方式、項目、濃度或總量限值、研訂基準及其他
應遵行之事項。直轄市、縣 (市) 主管機關得視轄區內環境特殊或需特予
保護之水體，就排放總量或濃度、管制項目或方式，增訂或加嚴轄內之放
流水標準，報請中央主管機關會商相關目的事業主管機關後核定之。

本法第四十條、第四十三條、第四十六條、第四十六條之一、第四十九條
、第五十二條、第五十三條及第五十四條所稱之情節重大，係指下列情形
之一者：
一、未經合法登記或許可之污染源，違反本法之規定。
二、經處分後，自報停工改善，經查證非屬實。
三、一年內經二次限期改善，仍繼續違反本法規定。
四、工業區內事業單位，將廢（污）水納入工業區污水下水道系統處理，
    而違反下水道相關法令規定，經下水道機構依下水道法規定以情節重
    大通知停止使用，仍繼續排放廢（污）水。
五、大量排放污染物，經主管機關認定嚴重影響附近水體品質。
六、排放之廢（污）水中含有有害健康物質，經主管機關認定有危害公眾
    健康之虞。
七、其他經主管機關認定嚴重影響附近地區水體品質之行為。
主管機關應公開依前項規定認定情節重大之事業，由提供優惠待遇之目的
事業主管機關或各該法律之主管機關停止並追回其違規行為所屬年度之優
惠待遇，並於其後三年內不得享受政府之優惠待遇。
前項所稱優惠待遇，包含中央或地方政府依法律或行政行為所給予該事業
獎勵、補助、捐助或減免之租稅、租金、費用或其他一切優惠措施。

自然人、法人、設有代表人或管理人之非法人團體、中央或地方機關（構
）或其他組織違反環境保護法律或自治條例之行政法上義務，經處分機關
處分停工、停業或新臺幣五千元以上罰鍰者，處分機關並應令該自然人、
法人、機關或團體指派有代表權之人或負責環境保護權責人員接受一小時
以上八小時以下環境講習。