四十八、各機關預付款項應按適當支出科目簽具付款憑單，送財政局辦理 支付；財政局應照憑單所列支付科目列帳。 各機關於本年度內支付之預付款收回時，應以支出收回處理；如 在年度結束後繳還者，應填具繳款書繳庫。
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四十九、經財政局核定之經費墊撥數，由各機關於履行支付責任時簽開付 款憑單。 墊付款應於完成法定預算程序後，由各機關按正式科目及實際墊 付支用金額開立轉帳憑單，送財政局辦理轉正，將已提墊支用數 轉列為正式預算科目之支付數，以減除其可支庫款餘額。
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五十、各機關費款須以外幣支付者，應由各機關簽具以結匯銀行為受款人 之付款憑單，並於摘要欄列明外幣種類、金額及折合新臺幣金額， 送財政局辦理支付。
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五十一、本府債務之還本付息，由各權責機關於到期前，簽具付款憑單， 送財政局辦理支付，除基金債務外，應依據分配預算辦理。
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五十二、會計年度結束後，應付歲出款未經核定前，基於事實需要，須先 行支付之款項，財政局依各機關填具付款憑單，於原申請保留年 度科目經費內先行暫付，俟應付歲出款核定後，再行辦理轉正。 倘保留未經核准，或僅部分核准者，其已支付或溢付之款項，應 由各機關負責收回。
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五十三、總預算內各統籌科目支付時，各機關應於本府或主計處核定之分 配預算內，簽具付款憑單，送財政局辦理支付。
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五十四、核定實施集中支付之基金保管款，自實施日起，其經管機關原設 基金保管款專戶應即停止支付，並與該帳戶核對，除已簽發支票 未兌現部分保留待兌並積極清理外，餘額應即以繳款書或匯存方 式繳存市庫存款戶各該專戶分戶。 前項專戶餘款結清後，除有特殊事由經核准得留存原專戶外，應 即辦理銷戶。
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五十五、基金保管款實施集中支付後，一切收支均應經由市庫存款戶，收 入除以匯款（含轉帳）方式存入者外，均應填具繳款書解繳市庫 存款戶；支付應編製付款憑單送財政局於餘額範圍內辦理支付。 前項收入係以匯款（含轉帳）方式存入者，各機關得以公庫服務 網交易明細表（加蓋列印人員職章）作為收入入帳之原始憑證。 財政局應於年度結束時，將基金保管款未支用餘額結轉入下年度 繼續支用。
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