依第五十四條之一第二項、第六十三條之五第二項、第七十八條之一或第七十八條之三第二項規定申請使用人，有下列情形之一者，廢止其許可：一、違反第六十三條之五第一項、第六章有關禁止或應行辦理事項、第七 十八條、第七十八條之三第一項、第八十條或第八十一條規定。二、堰壩及水庫蓄水範圍內，有關使用管理或其他應遵行事項，違反依第 五十四條之二所定之辦法。三、海堤區域內，有關使用管理、防潮搶險、海堤安全之檢查與養護或其 他應遵行事項，違反依第六十三條之六所定之管理辦法。四、河川整治之規劃與施設、河防安全檢查與養護、河川防洪與搶險、河 川區域之使用管理或其他應遵行事項，違反依第七十八條之二第一項 所定之河川管理辦法。五、排水設施管理之維護管理、防洪搶險、安全檢查、設施範圍之使用管 理或其他應遵行事項，違反依第七十八條之四所定之管理辦法。六、自取得許可之日，未經主管機關許可，逾六個月未使用。七、經催繳未在通知期限內繳清使用費。八、轉讓他人使用或未依許可內容或其範圍使用。九、因故意或重大過失管理不當，致他人於其使用範圍，有違反許可使用 內容或其範圍使用。十、許可使用後，喪失申請資格。十一、為水利設施整治、管理、公共使用或其他防救緊急危險之必要。使用人有前項第八款所定未依許可內容或其範圍使用之情形，而廢止其許可對公益有重大危害之虞者，主管機關得不予廢止，限期令使用人改善；屆期未完成改善者，處新臺幣十五萬元以上三百萬元以下罰鍰，並得按次處罰。依法撤銷許可或依第一項第一款至第九款規定廢止許可者，使用人有可歸責之事由時，於一年內不得再申請使用。

有下列情形之一者，處新臺幣二十五萬元以上五百萬元以下罰鍰：一、違反第五十四條之一第一項第一款、第六十三條之五第一項第一款、 第七十八條第二款、第七十八條之三第一項第二款規定，毀壞、毀損 或變更海堤、蓄水建造物或設備、河防建造物、設備或供防汛、搶險 用之土石料及其他物料或排水設施。二、違反第五十四條之一第一項第二款、第六十三條之五第一項第二款、 第七十八條第三款、第七十八條之三第一項第三款規定，啟閉、移動 或毀壞水閘門或其附屬設施。三、違反第六十五條第一項規定，使用水道洪水氾濫所及之土地。四、違反第七十八條第一款、第七十八條之三第一項第一款規定，填塞河 川水路或排水路。五、違反第五十四條之一第一項第三款、第六十三條之五第一項第三款、 第七十八條第五款、第七十八條之三第一項第四款規定，棄置廢土、 廢棄物或其他足以妨礙水流之物。六、違反第六十三條之五第一項第四款規定，採取或堆置土石。七、違反第七十八條之一第三款、第七十八條之三第二項第三款規定，未 經許可採取或堆置土石。法人、設有代表人或管理人之非法人團體或法人以外之其他私法組織，意圖營利，有前項第六款、第七款情形之一，未經許可採取土石者，得加重其罰鍰最高額至新臺幣一千萬元。

有下列情形之一者，處新臺幣十五萬元以上三百萬元以下罰鍰：一、違反第七十八條第四款規定，建造工廠或房屋。二、違反第七十八條之一第一款、第二款、第七十八條之三第二項第一款 、第二款規定，未經許可施設、改建、修復或拆除建造物、排注廢污 水或引取用水。

有下列情形之一者，處新臺幣二萬五千元以上五十萬元以下罰鍰：一、違反第五十四條之一第一項第四款規定，採取土石。二、違反第五十四條之一第一項第六款規定，排放不符水污染防治主管機 關放流水標準之污水。三、違反第五十四條之一第一項第五款、第六十三條之五第一項第五款、 第七十八條之一第六款、第七十八條之三第一項第五款規定，種植或 採伐植物、飼養牲畜、養殖水產物、圍築魚塭、插、吊蚵或其他養殖 行為。四、違反第七十八條第七款規定，有其他妨礙河川防護之行為。五、違反第七十八條之一第四款、第七十八條之三第二項第四款規定，未 經許可種植植物。六、違反第七十八條之一第五款、第七十八條之三第二項第五款規定，挖 掘、埋填或變更河川區域或排水設施範圍內原有形態之使用行為。七、違反第七十八條之三第一項第六款規定，有其他妨礙排水之行為。

違反第四十六條第一項、第二項、第四十七條、第五十四條之一第一項、第二項、第六十三條之五、第七十八條、第七十八條之一、第七十八條之三或第六十五條第二項所定辦法有關土地限制使用規定者，主管機關得限期令行為人回復原狀、拆除、清除或為適當之處理；屆期不遵行者，得按次處新臺幣一萬元以上二十萬元以下罰鍰。前項之行為人不明或無法履行義務時，主管機關得令前項違法情事所在之建造物或土地之所有人、管理人或使用人限期回復原狀、拆除、清除或為適當之處理；屆期不遵行者，得按次處新臺幣一萬元以上二十萬元以下罰鍰。前二項之行為人、違法情事所在之建造物或土地之所有人、管理人或使用人，屆期不遵行主管機關之命令時，主管機關得代為履行，並命其繳納代履行之費用。

違反第四十六條第一項、第二項、第四十七條、第五十四條之一第一項、第二項、第六十三條之五、第七十八條、第七十八條之一、第七十八條之三、第六十五條第二項所定辦法有關土地限制使用規定或有第九十三條第一項規定之情形者，主管機關得沒入行為人使用之設施、機具、機件或工具，並得公告拍賣之。

下列依本法規定應處罰鍰之行為，屬首度查獲，情節輕微，且已依限回復原狀、拆除、清除或適當之處理者，免予處罰：一、違反第五十四條之一第一項第五款、第六十三條之五第二項、第七十 八條之一第四款、第七十八條之三第二項第四款規定，於水庫蓄水範 圍、海堤區域、河川區域及排水設施範圍內之私有土地上種植草本植 物之行為。二、於依治理計畫完成堤防、既有堤防或高水護岸之堤後（不含河防建造 物及水防道路）河川區域內，違反第七十八條第四款至第六款、第七 十八條之一各款規定，且無影響堤防或護岸安全之虞。三、於依治理計畫完成排水設施或既有排水設施後之排水設施範圍內（不 含排水設施及水防道路），有違反第七十八條之三第一項第四款、第 五款、第七十八條之三第二項各款規定，且無影響排水設施安全之虞 。四、裁罰金額在新臺幣三千元以下，經主管機關認以不處罰為適當。主管機關對依前項規定免予處罰者，應予以糾正，並作成紀錄，命其簽名。

下列依本法應處罰鍰之行為，屬首度查獲，未致人於死、重傷或致生災害，且已依限回復原狀、拆除、清除或適當之處理者，處新臺幣二千五百元以上五萬元以下罰鍰：一、違反第五十四條之一第一項第三款、第六十三條之五第一項第三款、 第七十八條第五款、第七十八條之三第一項第四款規定，於水庫蓄水 範圍、海堤區域、河川區域或排水設施範圍內棄置一定數量以下之一 般廢土或廢棄物。但從事廢棄物貯存、清除或處理業務，不適用之。二、違反第五十四條之一第一項第四款、第六十三條之五第一項第四款、 第七十八條之一第三款、第七十八條之三第二項第三款規定，於水庫 蓄水範圍、海堤區域、河川區域或排水設施範圍內採取或堆置一定數 量以下之土石。但從事礦業、土石採取業、營建工程業、水泥及其製 品製造業、石材製品製造業等營利事業或其他以營利為目的者，不適 用之。三、違反第五十四條之一第一項第五款、第六十三條之五第二項、第七十 八條之一第四款、第七十八條之三第二項第四款規定，於水庫蓄水範 圍、海堤區域、河川區域或排水設施範圍內之公有土地上種植草本植 物且面積在一定規模以下。四、違反第七十八條第四款規定，於河川區域內建造面積在一定規模以下 之工廠或房屋，其土地登記謄本使用分區未標示河川區，且經其他機 關依其職掌許可或核准。五、違反第七十八條之一第五款、第七十八條之三第二項第五款規定，未 經許可於河川區域或排水設施範圍內之私有土地上挖掘、埋填或變更 原有形態之使用行為，面積在一定規模以下且無影響堤防、護岸、排 水設施安全或妨礙水流之虞。六、其他經主管機關公告情節輕微之行為。前項規定之一定數量或面積一定規模，由主管機關公告之。